24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2302 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2302  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  946    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000035123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5558  hypothetical protein  54.36 
 
 		 483 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.651155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5099  hypothetical protein  53.2 
 
 		 483 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2095  hypothetical protein  55.61 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629039  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3121  hypothetical protein  53.65 
 
 		 459 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36375  hypothetical protein  54.44 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4010  hypothetical protein  51.52 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328091  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3017  hypothetical protein  51.97 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3251  hypothetical protein  51.57 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2510  hypothetical protein  50.97 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.973885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2659  hypothetical protein  50 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1424  hypothetical protein  46.77 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.375453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3908  hypothetical protein  47.47 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0384197  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0671  hypothetical protein  36.41 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2977  hypothetical protein  55.12 
 
 		 150 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  normal  0.29912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3923  hypothetical protein  33.5 
 
 		 726 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1641  hypothetical protein  36.07 
 
 		 651 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.996629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01918  hypothetical protein  29.83 
 
 		 698 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.343555  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2818  hypothetical protein  35.2 
 
 		 717 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03051  hypothetical protein  29.03 
 
 		 689 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00894237  normal  0.803051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0257  hypothetical protein  27.18 
 
 		 755 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3096  hypothetical protein  29.78 
 
 		 729 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3277  hypothetical protein  28.79 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  78.26 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>