16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2977 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2977  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  normal  0.29912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2510  hypothetical protein  59.85 
 
 		 443 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.973885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3251  hypothetical protein  59.85 
 
 		 443 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3017  hypothetical protein  63.78 
 
 		 441 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2659  hypothetical protein  66.93 
 
 		 444 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2095  hypothetical protein  60.63 
 
 		 458 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629039  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5099  hypothetical protein  55.12 
 
 		 483 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5558  hypothetical protein  53.54 
 
 		 483 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.651155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2302  hypothetical protein  55.12 
 
 		 466 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000035123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4010  hypothetical protein  54.33 
 
 		 490 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328091  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1424  hypothetical protein  45.67 
 
 		 497 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.375453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0671  hypothetical protein  44.88 
 
 		 492 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3908  hypothetical protein  48.03 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0384197  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3121  hypothetical protein  46.46 
 
 		 459 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36375  hypothetical protein  47.24 
 
 		 474 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1641  hypothetical protein  35.29 
 
 		 651 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.996629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>