24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36375 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_36375  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  951    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0334122  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3121  hypothetical protein  86.27 
 
 
459 aa  792    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2302  hypothetical protein  53 
 
 
466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000035123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2095  hypothetical protein  52 
 
 
458 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629039  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5099  hypothetical protein  48.39 
 
 
483 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5558  hypothetical protein  48.88 
 
 
483 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.651155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3017  hypothetical protein  53.04 
 
 
441 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3251  hypothetical protein  48.88 
 
 
443 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1424  hypothetical protein  42.86 
 
 
497 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.375453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2510  hypothetical protein  47.98 
 
 
443 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.973885  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2659  hypothetical protein  47.47 
 
 
444 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4010  hypothetical protein  44.95 
 
 
490 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328091  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3908  hypothetical protein  43.54 
 
 
499 aa  356  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0384197  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0671  hypothetical protein  36.07 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2977  hypothetical protein  47.24 
 
 
150 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  normal  0.29912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1641  hypothetical protein  35.98 
 
 
651 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.996629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3923  hypothetical protein  32.42 
 
 
726 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2818  hypothetical protein  32.39 
 
 
717 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245022  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01918  hypothetical protein  32.3 
 
 
698 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.343555  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0257  hypothetical protein  27.22 
 
 
755 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03051  hypothetical protein  29.89 
 
 
689 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00894237  normal  0.803051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3277  hypothetical protein  32.52 
 
 
730 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3096  hypothetical protein  28.57 
 
 
729 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  77.27 
 
 
461 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>