22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3923 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3923  hypothetical protein  100 
 
 		 726 aa  1422    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0257  hypothetical protein  35.91 
 
 		 755 aa  326  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03051  hypothetical protein  36.35 
 
 		 689 aa  294  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00894237  normal  0.803051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1641  hypothetical protein  32.85 
 
 		 651 aa  208  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.996629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01918  hypothetical protein  29.69 
 
 		 698 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.343555  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2818  hypothetical protein  28.18 
 
 		 717 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3277  hypothetical protein  27.74 
 
 		 730 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3096  hypothetical protein  29.71 
 
 		 729 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5558  hypothetical protein  29.57 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.651155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4010  hypothetical protein  31.91 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328091  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5099  hypothetical protein  29.68 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1424  hypothetical protein  30.93 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.375453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2302  hypothetical protein  33.5 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000035123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3251  hypothetical protein  29.79 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2510  hypothetical protein  30.56 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.973885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3121  hypothetical protein  32.97 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36375  hypothetical protein  33.52 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2659  hypothetical protein  31.52 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3908  hypothetical protein  32.72 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0384197  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2095  hypothetical protein  33.67 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629039  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3017  hypothetical protein  27.72 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0671  hypothetical protein  24.26 
 
 		 492 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>