More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2270 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3315  flavin-containing monooxygenase FMO  65.91 
 
 		 445 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803176 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6584  flavin-containing monooxygenase FMO  65.61 
 
 		 445 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665869  normal  0.0116505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2270  flavin-containing monooxygenase FMO  100 
 
 		 459 aa  962    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22913  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5648  flavin-containing monooxygenase FMO  66.29 
 
 		 445 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3459  flavin-containing monooxygenase  70.68 
 
 		 456 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0154  flavin-containing monooxygenase FMO  66.67 
 
 		 447 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3604  Flavin-containing monooxygenase  63.64 
 
 		 451 aa  614  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30590  predicted flavoprotein involved in K+ transport  56.54 
 
 		 453 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.888555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1201  flavin-containing monooxygenase FMO  57.88 
 
 		 447 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5135  flavin-containing monooxygenase  57.88 
 
 		 447 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0516  flavin-containing monooxygenase FMO  55.43 
 
 		 446 aa  528  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08206  flavin dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03380)  25.77 
 
 		 488 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018027  normal  0.367841 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17607  predicted protein  27.54 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0505566  normal  0.490824 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30092  flavin-containing monooxygenase  23.38 
 
 		 508 aa  107  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.939114  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04110  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01002)  25.66 
 
 		 492 aa  106  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66263  flavin-containing monooxygenase  26.45 
 
 		 509 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.55333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1820  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  25.61 
 
 		 454 aa  103  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03043  hypothetical protein  25.96 
 
 		 483 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  33.33 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35832  predicted protein  28.4 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495105  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05250  T3P18.10, putative  24.42 
 
 		 557 aa  98.6  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07010  monooxygenase, putative  31.36 
 
 		 658 aa  98.6  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0106251  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  31.74 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  31.3 
 
 		 446 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02197  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 		 480 aa  93.2  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  28.84 
 
 		 558 aa  91.3  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28322  predicted protein  25 
 
 		 567 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109658  normal  0.410936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  28.38 
 
 		 495 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.63 
 
 		 362 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  26.52 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  22.6 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  25.22 
 
 		 609 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32260  flavin-containing monooxygenase  29.86 
 
 		 507 aa  79.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1820  flavin-containing monooxygenase FMO  29.78 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3504  flavin-containing monooxygenase FMO  26.03 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  28.99 
 
 		 640 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4944  flavin-containing monooxygenase FMO  25.66 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4373  flavin-containing monooxygenase  29.1 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1733  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.84 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  23.81 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0603  flavin-containing monooxygenase  27.78 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1752  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  29.84 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.525754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1799  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.84 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3273  flavin-containing monooxygenase FMO  27.88 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.304511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2861  flavin-containing monooxygenase FMO  28.19 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000341045  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1971  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  27.49 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.75 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0443  flavin-containing monooxygenase  29.02 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337001  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.51 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.51 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.51 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  26.34 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  28.37 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  25.47 
 
 		 656 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  22.91 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1422  Flavin-containing monooxygenase  25.71 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3872  flavin-containing monooxygenase FMO  28.84 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  27.65 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.21 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47806  predicted protein  25.48 
 
 		 362 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.3 
 
 		 362 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  25.99 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  24.36 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.76 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52278  probable flavin-containing monooxygenase  24.02 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0508939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  27.05 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  23.73 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0696  flavin-containing monooxygenase FMO  28.71 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  27.23 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3427  putative monooxygenase  25.52 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3708  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0275457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  25.79 
 
 		 542 aa  63.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03139  conserved hypothetical protein  28.25 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.494149  normal  0.0649704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  25.47 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  28.71 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3377  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.968772  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3259  monooxygenase, flavin-binding  26.57 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.206652  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1114  monooxygenase flavin-binding family protein  26.57 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2087  monooxygenase flavin-binding family protein  26.57 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0469238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1474  flavin-binding monooxygenase-like protein  26.57 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3145  monooxygenase, flavin-binding  26.57 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1393  monooxygenase flavin-binding family protein  26.57 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3904  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.955647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  22.9 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2378  monooxygenase flavin-binding family protein  26.57 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.91 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.68 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3372  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.38 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.057786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2415  cyclohexanone monooxygenase  25.52 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  24.27 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.86 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 543 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2374  cyclohexanone monooxygenase  24.71 
 
 		 498 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.845854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2421  cyclohexanone monooxygenase  24.71 
 
 		 498 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.423318  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3703  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  23.81 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>