More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0154 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3315  flavin-containing monooxygenase FMO  70.29 
 
 
445 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803176 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6584  flavin-containing monooxygenase FMO  70.07 
 
 
445 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665869  normal  0.0116505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0154  flavin-containing monooxygenase FMO  100 
 
 
447 aa  934    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5648  flavin-containing monooxygenase FMO  70.98 
 
 
445 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3459  flavin-containing monooxygenase  69.44 
 
 
456 aa  663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2270  flavin-containing monooxygenase FMO  66.67 
 
 
459 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22913  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3604  Flavin-containing monooxygenase  63.96 
 
 
451 aa  615  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30590  predicted flavoprotein involved in K+ transport  59.28 
 
 
453 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.888555  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1201  flavin-containing monooxygenase FMO  58.52 
 
 
447 aa  551  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602205  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0516  flavin-containing monooxygenase FMO  56.24 
 
 
446 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5135  flavin-containing monooxygenase  56.63 
 
 
447 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17607  predicted protein  29.73 
 
 
431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0505566  normal  0.490824 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08206  flavin dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03380)  25.91 
 
 
488 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018027  normal  0.367841 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66263  flavin-containing monooxygenase  26.6 
 
 
509 aa  110  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.55333 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04110  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01002)  25.16 
 
 
492 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  34.96 
 
 
448 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30092  flavin-containing monooxygenase  25.29 
 
 
508 aa  107  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.939114  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07010  monooxygenase, putative  31.76 
 
 
658 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0106251  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05250  T3P18.10, putative  23.67 
 
 
557 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28322  predicted protein  25.06 
 
 
567 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109658  normal  0.410936 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03043  hypothetical protein  26.97 
 
 
483 aa  99.8  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35832  predicted protein  27.88 
 
 
473 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  31.8 
 
 
446 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  32.11 
 
 
446 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3872  flavin-containing monooxygenase FMO  24.94 
 
 
461 aa  94  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02197  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 
480 aa  89.7  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1971  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  24.4 
 
 
446 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1820  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  25.57 
 
 
454 aa  87  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4373  flavin-containing monooxygenase  24.76 
 
 
446 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  27.83 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32260  flavin-containing monooxygenase  23.57 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1820  flavin-containing monooxygenase FMO  30.22 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  24.87 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  25.65 
 
 
505 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.31 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  26.87 
 
 
558 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.31 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.31 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  24.48 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4944  flavin-containing monooxygenase FMO  24.2 
 
 
455 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  24.44 
 
 
638 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2861  flavin-containing monooxygenase FMO  33.02 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000341045  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1733  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  27.9 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1752  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  27.9 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.525754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1799  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  27.9 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47806  predicted protein  24.15 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  29.63 
 
 
640 aa  73.2  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  27.91 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0443  flavin-containing monooxygenase  29.54 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337001  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  28 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.05 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3504  flavin-containing monooxygenase FMO  27.95 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  26.89 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
487 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1422  Flavin-containing monooxygenase  23.4 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  24.45 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1951  flavin-containing monooxygenase  26.67 
 
 
458 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183741  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  26.89 
 
 
656 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  27.44 
 
 
460 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3273  flavin-containing monooxygenase FMO  27.49 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.304511  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0603  flavin-containing monooxygenase  30.09 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  27.41 
 
 
491 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3372  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
493 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.057786  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  26.83 
 
 
524 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5034  Cyclohexanone monooxygenase  27.8 
 
 
541 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.623836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3513  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
494 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  25.85 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  26.58 
 
 
496 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.38 
 
 
487 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0696  flavin-containing monooxygenase FMO  27.94 
 
 
452 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  26.27 
 
 
363 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.48 
 
 
485 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  26.72 
 
 
650 aa  63.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.4 
 
 
484 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3444  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.5 
 
 
491 aa  63.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  26.69 
 
 
517 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3427  putative monooxygenase  26.78 
 
 
483 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.16956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  27.15 
 
 
542 aa  63.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  28.16 
 
 
487 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  28.16 
 
 
487 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6774  flavin-containing monooxygenase FMO  27.81 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.651237  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21240  predicted flavoprotein involved in K+ transport  29.1 
 
 
607 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284302  normal  0.2026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.73 
 
 
529 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2977  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  29.93 
 
 
607 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3104  cyclohexanone monooxygenase  28.49 
 
 
494 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452732  normal  0.352064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
484 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1842  hypothetical protein  29.05 
 
 
645 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1366  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.88 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  27.91 
 
 
493 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  26.44 
 
 
505 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  26.16 
 
 
496 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.11 
 
 
496 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0551  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.11 
 
 
496 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.635944  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.11 
 
 
496 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.230445  hitchhiker  0.00837864 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  24.68 
 
 
565 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  28.57 
 
 
490 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  26.41 
 
 
508 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.88 
 
 
399 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>