More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3459 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6584  flavin-containing monooxygenase FMO  69.98 
 
 
445 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665869  normal  0.0116505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3459  flavin-containing monooxygenase  100 
 
 
456 aa  957    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0154  flavin-containing monooxygenase FMO  69.44 
 
 
447 aa  663    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3315  flavin-containing monooxygenase FMO  69.3 
 
 
445 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803176 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5648  flavin-containing monooxygenase FMO  70.2 
 
 
445 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2270  flavin-containing monooxygenase FMO  70.68 
 
 
459 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22913  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3604  Flavin-containing monooxygenase  67.95 
 
 
451 aa  631  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1201  flavin-containing monooxygenase FMO  59.68 
 
 
447 aa  568  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602205  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5135  flavin-containing monooxygenase  60.27 
 
 
447 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30590  predicted flavoprotein involved in K+ transport  57.96 
 
 
453 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.888555  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0516  flavin-containing monooxygenase FMO  56.95 
 
 
446 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08206  flavin dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03380)  26.5 
 
 
488 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018027  normal  0.367841 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17607  predicted protein  29.04 
 
 
431 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0505566  normal  0.490824 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30092  flavin-containing monooxygenase  24.65 
 
 
508 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.939114  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  25.73 
 
 
446 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  26.03 
 
 
446 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  35.22 
 
 
448 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35832  predicted protein  26.48 
 
 
473 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495105  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05250  T3P18.10, putative  26.37 
 
 
557 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28322  predicted protein  27.85 
 
 
567 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109658  normal  0.410936 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66263  flavin-containing monooxygenase  26.46 
 
 
509 aa  104  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.55333 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04110  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01002)  24.67 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03043  hypothetical protein  25.68 
 
 
483 aa  97.8  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  28.57 
 
 
495 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07010  monooxygenase, putative  30.04 
 
 
658 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0106251  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02197  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 
480 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  23.77 
 
 
480 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32260  flavin-containing monooxygenase  30.99 
 
 
507 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  27.12 
 
 
558 aa  87.4  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  24.71 
 
 
460 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  29.02 
 
 
505 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1820  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  25.06 
 
 
454 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1971  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.61 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3504  flavin-containing monooxygenase FMO  29.13 
 
 
468 aa  77  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2861  flavin-containing monooxygenase FMO  29.82 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000341045  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0603  flavin-containing monooxygenase  29.2 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.84 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.84 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.84 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1820  flavin-containing monooxygenase FMO  30.74 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  28.77 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1733  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  30.51 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1752  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  30.51 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.525754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1799  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  30.51 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3273  flavin-containing monooxygenase FMO  28.27 
 
 
468 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.304511  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4944  flavin-containing monooxygenase FMO  24.89 
 
 
455 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310384  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  28.29 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  24.9 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.07 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3872  flavin-containing monooxygenase FMO  24.47 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
642 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  28.3 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
487 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
642 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.9 
 
 
529 aa  70.1  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  29.02 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4373  flavin-containing monooxygenase  28.76 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52278  probable flavin-containing monooxygenase  27.9 
 
 
546 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0508939 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03139  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.494149  normal  0.0649704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.87 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  28.46 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05260  conserved hypothetical protein  26.84 
 
 
550 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  30.63 
 
 
640 aa  67.4  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3444  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26 
 
 
491 aa  67.4  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  26.19 
 
 
656 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0696  flavin-containing monooxygenase FMO  25.37 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
380 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.39 
 
 
506 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0443  flavin-containing monooxygenase  28.38 
 
 
475 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337001  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
484 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2883  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
640 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  27.4 
 
 
487 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  27.4 
 
 
487 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  25.91 
 
 
565 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3708  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
494 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0275457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2671  cyclohexanone monooxygenase  29.31 
 
 
498 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  26.89 
 
 
650 aa  64.3  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
483 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.17 
 
 
494 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1842  hypothetical protein  28.1 
 
 
645 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3377  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.968772  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1422  Flavin-containing monooxygenase  25.32 
 
 
434 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  26.34 
 
 
505 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  23.01 
 
 
638 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3372  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.93 
 
 
493 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.057786  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  24.79 
 
 
527 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.8 
 
 
484 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  24.89 
 
 
509 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0551  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
496 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.635944  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
496 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
496 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.230445  hitchhiker  0.00837864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
494 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3513  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
494 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
494 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
494 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  22.92 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  25.37 
 
 
487 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  25.6 
 
 
661 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.33 
 
 
326 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.39 
 
 
326 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>