More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3315 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0154  flavin-containing monooxygenase FMO  70.29 
 
 
447 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3315  flavin-containing monooxygenase FMO  100 
 
 
445 aa  934    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2270  flavin-containing monooxygenase FMO  65.91 
 
 
459 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22913  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6584  flavin-containing monooxygenase FMO  93.47 
 
 
445 aa  884    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665869  normal  0.0116505 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5648  flavin-containing monooxygenase FMO  92.79 
 
 
445 aa  879    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3459  flavin-containing monooxygenase  69.3 
 
 
456 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3604  Flavin-containing monooxygenase  67.19 
 
 
451 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0516  flavin-containing monooxygenase FMO  57.21 
 
 
446 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1201  flavin-containing monooxygenase FMO  57.17 
 
 
447 aa  552  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602205  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30590  predicted flavoprotein involved in K+ transport  57.08 
 
 
453 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.888555  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5135  flavin-containing monooxygenase  57.85 
 
 
447 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08206  flavin dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03380)  26.55 
 
 
488 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018027  normal  0.367841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  28.33 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17607  predicted protein  26.79 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0505566  normal  0.490824 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04110  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01002)  25.33 
 
 
492 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05250  T3P18.10, putative  25 
 
 
557 aa  106  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03043  hypothetical protein  27.97 
 
 
483 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1820  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  26.73 
 
 
454 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66263  flavin-containing monooxygenase  26.68 
 
 
509 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.55333 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30092  flavin-containing monooxygenase  24.06 
 
 
508 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.939114  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  32.61 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02197  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 
480 aa  98.2  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  32.61 
 
 
446 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07010  monooxygenase, putative  26.74 
 
 
658 aa  98.2  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0106251  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35832  predicted protein  26.87 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495105  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28322  predicted protein  23.44 
 
 
567 aa  90.5  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109658  normal  0.410936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3872  flavin-containing monooxygenase FMO  25.06 
 
 
461 aa  89.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.13 
 
 
495 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  27.39 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32260  flavin-containing monooxygenase  30.08 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  27.23 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0603  flavin-containing monooxygenase  24.02 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  24.6 
 
 
442 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2861  flavin-containing monooxygenase FMO  30.64 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000341045  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3504  flavin-containing monooxygenase FMO  30.4 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  25.44 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  36.52 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3273  flavin-containing monooxygenase FMO  30.84 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.304511  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  24.38 
 
 
609 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1971  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  28.88 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4373  flavin-containing monooxygenase  29 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4944  flavin-containing monooxygenase FMO  25.69 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310384  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  26.79 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
380 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02558  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15050)  28.57 
 
 
610 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03139  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.494149  normal  0.0649704 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  27.04 
 
 
640 aa  67.8  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.7 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.7 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.7 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1820  flavin-containing monooxygenase FMO  26.53 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  28.16 
 
 
491 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  27.85 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1733  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.61 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  25.85 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1752  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  29.61 
 
 
450 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.525754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1799  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.61 
 
 
450 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
487 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.21 
 
 
362 aa  63.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3703  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
662 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.31 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0443  flavin-containing monooxygenase  26.58 
 
 
475 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337001  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47806  predicted protein  23.4 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
484 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.21 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0551  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.88 
 
 
496 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.635944  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.88 
 
 
496 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.88 
 
 
496 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.230445  hitchhiker  0.00837864 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52278  probable flavin-containing monooxygenase  23.48 
 
 
546 aa  60.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0508939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0696  flavin-containing monooxygenase FMO  23.18 
 
 
452 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  25.47 
 
 
656 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  23.11 
 
 
638 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3372  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.92 
 
 
493 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.057786  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3104  cyclohexanone monooxygenase  22.62 
 
 
494 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452732  normal  0.352064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.56 
 
 
494 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  26.32 
 
 
490 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3427  putative monooxygenase  26.07 
 
 
483 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.16956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.04 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1422  Flavin-containing monooxygenase  23.92 
 
 
434 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06683  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 
503 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6774  flavin-containing monooxygenase FMO  25.4 
 
 
464 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.651237  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  25.84 
 
 
505 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  26.57 
 
 
493 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2894  cyclohexanone monooxygenase  25.37 
 
 
536 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293401  normal  0.176776 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05260  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 
550 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09282  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03020)  24.2 
 
 
642 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.709701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  20.86 
 
 
364 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  25.48 
 
 
487 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  25.82 
 
 
363 aa  56.6  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.51 
 
 
375 aa  56.6  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  25.48 
 
 
487 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.16 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 
483 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  25.31 
 
 
601 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.88 
 
 
399 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
543 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  26.32 
 
 
491 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0330  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
540 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  25.6 
 
 
496 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  25.6 
 
 
496 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>