70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0603 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  100 
 
 
420 aa  877    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  68.26 
 
 
468 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  68.26 
 
 
468 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  68.26 
 
 
468 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  68.26 
 
 
468 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  68.26 
 
 
468 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
468 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  62.57 
 
 
456 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105958  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  41.75 
 
 
447 aa  345  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
447 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  40.84 
 
 
447 aa  332  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  40.84 
 
 
447 aa  332  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  42.43 
 
 
435 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  40.65 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  40.4 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  40.4 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  40.4 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  40.4 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  40.1 
 
 
448 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  40.1 
 
 
448 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  35.64 
 
 
433 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  35.64 
 
 
433 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  35.64 
 
 
433 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  35.64 
 
 
433 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  34.4 
 
 
441 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  34 
 
 
494 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  34.65 
 
 
433 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2324  transposase, IS4  84.75 
 
 
118 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0625912  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  43.87 
 
 
325 aa  193  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7794  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
241 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  29.77 
 
 
451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  29.77 
 
 
451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  29.77 
 
 
451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  29.77 
 
 
451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  29.77 
 
 
451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  30.32 
 
 
451 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1632  transposase, IS4  37.34 
 
 
263 aa  146  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  34.72 
 
 
255 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3389  hypothetical protein  38.24 
 
 
198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5077  hypothetical protein  43.33 
 
 
177 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23249  normal  0.479185 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0086  transposase (24)  38.51 
 
 
167 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2484  hypothetical protein  39.62 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0142982  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1630  hypothetical protein  37.37 
 
 
111 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1627  transposase, IS4  36.14 
 
 
111 aa  57  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  23.28 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  20.67 
 
 
465 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2613  hypothetical protein  20.67 
 
 
441 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0096  hypothetical protein  35.82 
 
 
78 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>