38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0096 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0096  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3389  hypothetical protein  93.59 
 
 
198 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  97.4 
 
 
448 aa  148  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  97.4 
 
 
448 aa  148  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  60.26 
 
 
435 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  41.1 
 
 
447 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  36.99 
 
 
447 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  39.73 
 
 
447 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  36.99 
 
 
447 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  35.06 
 
 
468 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  35.06 
 
 
468 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  35.06 
 
 
468 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  35.06 
 
 
468 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  35.06 
 
 
468 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  35.82 
 
 
420 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 
468 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 
468 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 
468 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 
468 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 
468 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 
468 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 
468 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 
468 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 
468 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>