55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5077 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_5077  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  357  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23249  normal  0.479185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  75.83 
 
 
447 aa  191  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  75.83 
 
 
447 aa  191  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  65.83 
 
 
447 aa  158  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  62.5 
 
 
447 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7794  transposase IS4 family protein  54.17 
 
 
241 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
448 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
448 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  43.33 
 
 
420 aa  98.2  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  38.33 
 
 
468 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
468 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
468 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
468 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
468 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
468 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
468 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
456 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105958  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
468 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
468 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  38.33 
 
 
468 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  38.33 
 
 
468 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  38.33 
 
 
468 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  38.33 
 
 
468 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  39.17 
 
 
468 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  43.8 
 
 
325 aa  96.7  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
397 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
397 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
397 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
397 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
397 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  39.67 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  36.57 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2484  hypothetical protein  42.67 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0142982  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  28.33 
 
 
433 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  31.58 
 
 
494 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  30.26 
 
 
255 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  27.78 
 
 
433 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  27.78 
 
 
433 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  27.78 
 
 
433 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  27.78 
 
 
433 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1627  transposase, IS4  34.67 
 
 
111 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>