89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0952 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0952  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.600635  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  38.25 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0035  hypothetical protein  37.26 
 
 
292 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5263  hypothetical protein  38.71 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
313 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  32.95 
 
 
272 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  27.76 
 
 
265 aa  136  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  27.31 
 
 
274 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1037  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  29.46 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  28.52 
 
 
274 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  28.11 
 
 
271 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  27.31 
 
 
271 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  27.31 
 
 
271 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  27.31 
 
 
271 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  27.17 
 
 
273 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  27.17 
 
 
271 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  27.17 
 
 
273 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
299 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  26.07 
 
 
271 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  28.06 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  23.11 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  25.9 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  25.29 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  23.05 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  24.71 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  21.65 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  22.9 
 
 
272 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.61 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  23.11 
 
 
247 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 
258 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  23.46 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  21.69 
 
 
250 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  22.58 
 
 
255 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  21.91 
 
 
247 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  23.26 
 
 
254 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  22.67 
 
 
253 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3124  alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  22.99 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  22.92 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  23.23 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  22.31 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  21.54 
 
 
257 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  21.51 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  21.51 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  21.12 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  21.51 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  21.51 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  21.51 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  21.51 
 
 
247 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  21.51 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  21.51 
 
 
247 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  22.67 
 
 
262 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  21.05 
 
 
253 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1336  putative carboxylesterase  27.52 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  20.4 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  22.27 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  35.11 
 
 
262 aa  48.9  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  29.03 
 
 
383 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  21.09 
 
 
733 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  22.52 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  19.92 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  21.84 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  23.38 
 
 
270 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  21.79 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  20.24 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  20.08 
 
 
227 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0547  putative carboxylesterase  23.6 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  43.9 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  31.73 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  31.73 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  28.35 
 
 
389 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0449  carboxylesterase  21.12 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  28.7 
 
 
397 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  20.16 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  21.58 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0850  hypothetical protein  32.56 
 
 
203 aa  42.7  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  29.27 
 
 
411 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  23.19 
 
 
257 aa  42.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  30.48 
 
 
390 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>