29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0339 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0339  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 306 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.568595  normal  0.124479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  23.35 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  22.9 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  23.27 
 
 		 330 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  22.97 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  22.36 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  22.86 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  21.39 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  22.97 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  30.23 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  23.72 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.64 
 
 		 273 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  32.18 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 1523 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  25.81 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  25.9 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  24.55 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 		 1523 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.91 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 353 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.66 
 
 		 353 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  25.71 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  21.98 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  21.28 
 
 		 332 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>