49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3106 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.562528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1464  hypothetical protein  81.25 
 
 		 226 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1082  hypothetical protein  76.34 
 
 		 229 aa  346  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1124  hypothetical protein  80.8 
 
 		 229 aa  341  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0759553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39230  hypothetical protein  76.44 
 
 		 225 aa  331  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0828617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4100  hypothetical protein  79.02 
 
 		 229 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1518  hypothetical protein  79.02 
 
 		 228 aa  328  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49547  normal  0.73861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16830  hypothetical protein  80.8 
 
 		 226 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1518  hypothetical protein  77.58 
 
 		 229 aa  325  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4205  hypothetical protein  77.68 
 
 		 228 aa  323  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1326  hypothetical protein  76.42 
 
 		 229 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3770  hypothetical protein  57.49 
 
 		 231 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0880  hypothetical protein  51.56 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0698051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1024  hypothetical protein  51.56 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710014  normal  0.0649731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3881  hypothetical protein  52.74 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0218  hypothetical protein  49.77 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0271  hypothetical protein  50.72 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0319  hypothetical protein  48.84 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0587846  normal  0.021829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1729  hypothetical protein  52.45 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.161157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4045  hypothetical protein  48.22 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1986  hypothetical protein  44.78 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2427  hypothetical protein  47.3 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1681  hypothetical protein  38.5 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1213  hypothetical protein  38.74 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2254  hypothetical protein  37.02 
 
 		 249 aa  151  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0833602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0582  hypothetical protein  38.16 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2923  hypothetical protein  35.65 
 
 		 245 aa  134  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1401  hypothetical protein  38.34 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.014291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2642  hypothetical protein  33.5 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0501  hypothetical protein  34.95 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0457  hypothetical protein  34.85 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.216929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2882  hypothetical protein  37.31 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000228218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1914  hypothetical protein  34.83 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1209  hypothetical protein  37.95 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2631  hypothetical protein  35.89 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339053  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06865  hypothetical protein  35.35 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.081281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1405  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1358  hypothetical protein  34.85 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1072  hypothetical protein  38.14 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2981  hypothetical protein  37.63 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2683  hypothetical protein  32.89 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.779306  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1900  hypothetical protein  31.94 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000808161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2327  hypothetical protein  34.02 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0186  hypothetical protein  34.55 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.46142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0525  hypothetical protein  34.02 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0776  hypothetical protein  30.48 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0307702  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1798  hypothetical protein  29.29 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.688509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1482  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0009601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2391  hypothetical protein  25.95 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>