49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1358 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1358  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0457  hypothetical protein  65.14 
 
 
241 aa  300  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.216929  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2631  hypothetical protein  52 
 
 
241 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339053  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2642  hypothetical protein  47.03 
 
 
243 aa  199  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0186  hypothetical protein  52.06 
 
 
252 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.46142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2327  hypothetical protein  47.52 
 
 
239 aa  191  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0501  hypothetical protein  44.75 
 
 
248 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0525  hypothetical protein  44.39 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2254  hypothetical protein  44.83 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0833602  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06865  hypothetical protein  38.82 
 
 
234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.081281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1681  hypothetical protein  40.38 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0582  hypothetical protein  47.52 
 
 
248 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2882  hypothetical protein  39.24 
 
 
244 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000228218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1213  hypothetical protein  42.16 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2923  hypothetical protein  42.29 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1401  hypothetical protein  42.51 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.014291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2981  hypothetical protein  44.02 
 
 
246 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3881  hypothetical protein  40 
 
 
228 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1072  hypothetical protein  43.78 
 
 
244 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0880  hypothetical protein  35.41 
 
 
226 aa  148  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0698051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1024  hypothetical protein  35.41 
 
 
226 aa  148  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710014  normal  0.0649731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1405  putative lipoprotein  39.11 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1209  hypothetical protein  41.18 
 
 
243 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1464  hypothetical protein  37.88 
 
 
226 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1082  hypothetical protein  36.87 
 
 
229 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16830  hypothetical protein  37.76 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1986  hypothetical protein  34.45 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4205  hypothetical protein  37.5 
 
 
228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1518  hypothetical protein  37.5 
 
 
228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49547  normal  0.73861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4100  hypothetical protein  37 
 
 
229 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1124  hypothetical protein  36.5 
 
 
229 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0759553  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39230  hypothetical protein  37.88 
 
 
225 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0828617  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4045  hypothetical protein  32.71 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1326  hypothetical protein  35.86 
 
 
229 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1518  hypothetical protein  36.36 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2427  hypothetical protein  34.67 
 
 
224 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1914  hypothetical protein  31.02 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3106  hypothetical protein  34.85 
 
 
225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.562528  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1729  hypothetical protein  36.19 
 
 
254 aa  122  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.161157  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3770  hypothetical protein  30.28 
 
 
231 aa  118  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0319  hypothetical protein  32.2 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0587846  normal  0.021829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0271  hypothetical protein  29.85 
 
 
234 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2683  hypothetical protein  36.16 
 
 
285 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.779306  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0218  hypothetical protein  28.9 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0776  hypothetical protein  30.48 
 
 
237 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0307702  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1900  hypothetical protein  26.73 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000808161  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1798  hypothetical protein  28.24 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.688509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1482  hypothetical protein  26.61 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0009601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2391  hypothetical protein  23.96 
 
 
227 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>