40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2391 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2391  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2392  hypothetical protein  31.67 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0525  hypothetical protein  24.04 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1681  hypothetical protein  29.25 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1082  hypothetical protein  29.03 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2631  hypothetical protein  23.83 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339053  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1405  putative lipoprotein  30.96 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4205  hypothetical protein  27.32 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1124  hypothetical protein  26.63 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0759553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2923  hypothetical protein  21.46 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1518  hypothetical protein  27.32 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49547  normal  0.73861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4045  hypothetical protein  27.16 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1209  hypothetical protein  29 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1024  hypothetical protein  24.35 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710014  normal  0.0649731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0880  hypothetical protein  24.35 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0698051 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1900  hypothetical protein  20.28 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000808161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0776  hypothetical protein  26.63 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0307702  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0457  hypothetical protein  23.95 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.216929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2254  hypothetical protein  26.15 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0833602  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1464  hypothetical protein  26.4 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2683  hypothetical protein  29.6 
 
 		 285 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.779306  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2327  hypothetical protein  22.75 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1401  hypothetical protein  24.27 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.014291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16830  hypothetical protein  25.97 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06865  hypothetical protein  24.51 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.081281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1072  hypothetical protein  26.77 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2642  hypothetical protein  25.56 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4100  hypothetical protein  26.09 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0501  hypothetical protein  24.42 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1518  hypothetical protein  26.92 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2882  hypothetical protein  24.27 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000228218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2981  hypothetical protein  25.62 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1326  hypothetical protein  26.92 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3106  hypothetical protein  25.95 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.562528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3881  hypothetical protein  22.92 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39230  hypothetical protein  25.41 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0828617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1213  hypothetical protein  25.77 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1986  hypothetical protein  22.97 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1914  hypothetical protein  27.69 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0319  hypothetical protein  25 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0587846  normal  0.021829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>