50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4045 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4045  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  477  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0319  hypothetical protein  65.02 
 
 		 228 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0587846  normal  0.021829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0271  hypothetical protein  63.18 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0218  hypothetical protein  62.69 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3770  hypothetical protein  58.71 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1024  hypothetical protein  48 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710014  normal  0.0649731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0880  hypothetical protein  48 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0698051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1464  hypothetical protein  50.23 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16830  hypothetical protein  52.04 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1518  hypothetical protein  49 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49547  normal  0.73861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4205  hypothetical protein  49 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1082  hypothetical protein  48 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3106  hypothetical protein  45.05 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.562528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1124  hypothetical protein  47.5 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0759553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3881  hypothetical protein  46.08 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4100  hypothetical protein  47.5 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1729  hypothetical protein  49.04 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.161157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39230  hypothetical protein  49 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0828617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1326  hypothetical protein  49 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2427  hypothetical protein  45.5 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1518  hypothetical protein  48.5 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1986  hypothetical protein  43.94 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2882  hypothetical protein  41.12 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000228218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1401  hypothetical protein  41.12 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.014291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2923  hypothetical protein  37.21 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0582  hypothetical protein  40.8 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1681  hypothetical protein  38.19 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0776  hypothetical protein  39.23 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0307702  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1209  hypothetical protein  41.79 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2254  hypothetical protein  36.84 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0833602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1072  hypothetical protein  43.3 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1213  hypothetical protein  35.42 
 
 		 248 aa  132  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0457  hypothetical protein  33.66 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.216929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2981  hypothetical protein  37.18 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1900  hypothetical protein  32.87 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000808161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2642  hypothetical protein  35.24 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0501  hypothetical protein  31.56 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2327  hypothetical protein  36.41 
 
 		 239 aa  124  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0186  hypothetical protein  37.19 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.46142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1358  hypothetical protein  32.71 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1405  putative lipoprotein  34.86 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2631  hypothetical protein  34.72 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339053  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06865  hypothetical protein  37.89 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.081281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0525  hypothetical protein  32.99 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2683  hypothetical protein  34.26 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.779306  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1914  hypothetical protein  33.5 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1482  hypothetical protein  29.57 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0009601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1798  hypothetical protein  29 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.688509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2391  hypothetical protein  26.72 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30681  predicted protein  28.85 
 
 		 789 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0209542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>