49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06865 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06865  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.081281  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2327  hypothetical protein  62.45 
 
 
239 aa  308  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0525  hypothetical protein  49.58 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2631  hypothetical protein  44.49 
 
 
241 aa  204  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339053  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2642  hypothetical protein  40.16 
 
 
243 aa  182  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0186  hypothetical protein  49.49 
 
 
252 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.46142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0501  hypothetical protein  43.5 
 
 
248 aa  178  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0457  hypothetical protein  40.97 
 
 
241 aa  178  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.216929  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2254  hypothetical protein  40.7 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0833602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1358  hypothetical protein  43.07 
 
 
256 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1213  hypothetical protein  40.7 
 
 
248 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1681  hypothetical protein  38.5 
 
 
248 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1401  hypothetical protein  36.44 
 
 
247 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.014291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2923  hypothetical protein  37.75 
 
 
245 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2882  hypothetical protein  36.48 
 
 
244 aa  148  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000228218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1209  hypothetical protein  37.34 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2981  hypothetical protein  39.02 
 
 
246 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3881  hypothetical protein  39.15 
 
 
228 aa  141  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0880  hypothetical protein  38.54 
 
 
226 aa  138  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0698051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1024  hypothetical protein  38.54 
 
 
226 aa  138  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710014  normal  0.0649731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1072  hypothetical protein  39.09 
 
 
244 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1405  putative lipoprotein  34.86 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1326  hypothetical protein  36.68 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0582  hypothetical protein  33.77 
 
 
248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1082  hypothetical protein  35.19 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1464  hypothetical protein  34.35 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2427  hypothetical protein  35.5 
 
 
224 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4100  hypothetical protein  36.36 
 
 
229 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1518  hypothetical protein  36.18 
 
 
228 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49547  normal  0.73861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1518  hypothetical protein  35.35 
 
 
229 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1124  hypothetical protein  36.18 
 
 
229 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0759553  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4205  hypothetical protein  35.68 
 
 
228 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4045  hypothetical protein  37.89 
 
 
239 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16830  hypothetical protein  36.84 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3106  hypothetical protein  35.35 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.562528  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1729  hypothetical protein  35.86 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.161157  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1986  hypothetical protein  31.31 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648287  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0776  hypothetical protein  33.96 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0307702  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39230  hypothetical protein  34.34 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0828617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0271  hypothetical protein  34.17 
 
 
234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0319  hypothetical protein  32.66 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0587846  normal  0.021829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0218  hypothetical protein  34.17 
 
 
234 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2683  hypothetical protein  33.04 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.779306  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3770  hypothetical protein  33.51 
 
 
231 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1914  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1900  hypothetical protein  23.61 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000808161  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1482  hypothetical protein  25.91 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0009601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1798  hypothetical protein  24.27 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.688509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2391  hypothetical protein  24.51 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>