48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1798 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1798  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.688509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1482  hypothetical protein  58.87 
 
 
251 aa  276  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0009601  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1900  hypothetical protein  37.45 
 
 
266 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000808161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3881  hypothetical protein  34.4 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2923  hypothetical protein  32.8 
 
 
245 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1518  hypothetical protein  33.67 
 
 
228 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49547  normal  0.73861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2427  hypothetical protein  34.98 
 
 
224 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1464  hypothetical protein  32.33 
 
 
226 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4205  hypothetical protein  33.17 
 
 
228 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1124  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0759553  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4100  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16830  hypothetical protein  32.5 
 
 
226 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0271  hypothetical protein  33.48 
 
 
234 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3770  hypothetical protein  31.33 
 
 
231 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1986  hypothetical protein  29.26 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0880  hypothetical protein  30.2 
 
 
226 aa  99  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0698051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1024  hypothetical protein  30.2 
 
 
226 aa  99  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710014  normal  0.0649731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2882  hypothetical protein  28.46 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000228218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0218  hypothetical protein  30.89 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0319  hypothetical protein  28.51 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0587846  normal  0.021829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1401  hypothetical protein  28.77 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.014291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4045  hypothetical protein  29 
 
 
239 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302623 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2683  hypothetical protein  30.19 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.779306  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1213  hypothetical protein  28.57 
 
 
248 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3106  hypothetical protein  29.29 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.562528  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1082  hypothetical protein  29.69 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1681  hypothetical protein  25.81 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1518  hypothetical protein  27.07 
 
 
229 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39230  hypothetical protein  26.61 
 
 
225 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0828617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0582  hypothetical protein  30.34 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1326  hypothetical protein  27.94 
 
 
229 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1209  hypothetical protein  28.4 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2981  hypothetical protein  29.18 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2254  hypothetical protein  26.7 
 
 
249 aa  82  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0833602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2327  hypothetical protein  31.05 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1072  hypothetical protein  30.86 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1405  putative lipoprotein  25.99 
 
 
234 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0501  hypothetical protein  30.1 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0457  hypothetical protein  28.5 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.216929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1358  hypothetical protein  28.24 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1729  hypothetical protein  28.23 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.161157  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06865  hypothetical protein  24.27 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.081281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0525  hypothetical protein  27.8 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0776  hypothetical protein  22.73 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0307702  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1914  hypothetical protein  21.7 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0186  hypothetical protein  27.12 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.46142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2642  hypothetical protein  29.59 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2631  hypothetical protein  24.02 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339053  normal  0.502924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>