48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1729 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.161157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0880  hypothetical protein  55.29 
 
 		 226 aa  239  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0698051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1024  hypothetical protein  55.29 
 
 		 226 aa  239  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710014  normal  0.0649731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3881  hypothetical protein  51.96 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0271  hypothetical protein  54.29 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0319  hypothetical protein  55.22 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0587846  normal  0.021829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1124  hypothetical protein  53 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0759553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0218  hypothetical protein  50.46 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3106  hypothetical protein  52.45 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.562528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3770  hypothetical protein  54.41 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1464  hypothetical protein  52.68 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4100  hypothetical protein  52 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16830  hypothetical protein  53.3 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1518  hypothetical protein  51.5 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49547  normal  0.73861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4205  hypothetical protein  51 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1082  hypothetical protein  48.77 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1518  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1326  hypothetical protein  49.51 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0545015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1986  hypothetical protein  45.27 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4045  hypothetical protein  48.98 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2427  hypothetical protein  47.5 
 
 		 224 aa  185  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39230  hypothetical protein  48.34 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0828617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2923  hypothetical protein  38.24 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0582  hypothetical protein  44.28 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0501  hypothetical protein  38.74 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1213  hypothetical protein  36.55 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1209  hypothetical protein  40.49 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2254  hypothetical protein  40.7 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0833602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2631  hypothetical protein  37.32 
 
 		 241 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339053  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1401  hypothetical protein  41.18 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.014291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2882  hypothetical protein  40.2 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000228218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1681  hypothetical protein  34.68 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2981  hypothetical protein  40.39 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2642  hypothetical protein  36.16 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1900  hypothetical protein  35.19 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000808161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1072  hypothetical protein  36.11 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0186  hypothetical protein  37.06 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.46142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0457  hypothetical protein  36.87 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.216929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06865  hypothetical protein  35.86 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.081281  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2327  hypothetical protein  35.82 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0776  hypothetical protein  34.6 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0307702  normal  0.23634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0525  hypothetical protein  35.53 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2683  hypothetical protein  33.48 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.779306  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1358  hypothetical protein  36.19 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1914  hypothetical protein  32.02 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1405  putative lipoprotein  34.74 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1482  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0009601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1798  hypothetical protein  28.23 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.688509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>