43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2264 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2264  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  343  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1407  hypothetical protein  54.61 
 
 		 166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.246502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1376  Protein of unknown function DUF1790  51.95 
 
 		 167 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0854  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4947  hypothetical protein  51.95 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399738  hitchhiker  0.000000153474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4848  Protein of unknown function DUF1790  52.56 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  50.66 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3881  hypothetical protein  51.3 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.832488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1137  Protein of unknown function DUF1790  52.63 
 
 		 166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3770  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4025  Protein of unknown function DUF1790  50 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.351333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4064  Protein of unknown function DUF1790  50 
 
 		 168 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2513  hypothetical protein  50.66 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3105  hypothetical protein  51.27 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2546  hypothetical protein  51.61 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1259  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00906465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2148  hypothetical protein  47.53 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.8454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1641  hypothetical protein  48.08 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1475  hypothetical protein  48.05 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1525  hypothetical protein  48.05 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2250  hypothetical protein  46.67 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2756  Protein of unknown function DUF1790  46.2 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3019  Protein of unknown function DUF1790  46.2 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2703  hypothetical protein  43.64 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.600419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3169  hypothetical protein  48.1 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  44.91 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1096  Protein of unknown function DUF1790  44.16 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.820328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0991  hypothetical protein  44.51 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0359037  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0763  hypothetical protein  44.16 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.396097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4471  hypothetical protein  42.95 
 
 		 170 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.39855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0676  hypothetical protein  40.26 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0622  hypothetical protein  37.82 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0039  hypothetical protein  40.13 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158376  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1141  hypothetical protein  38.56 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2199  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2646  hypothetical protein  35.33 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1322  hypothetical protein  38.31 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3330  hypothetical protein  32.3 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.635014  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3008  hypothetical protein  35.93 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3363  hypothetical protein  35.93 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0545  hypothetical protein  30.3 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3255  hypothetical protein  31.46 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0701128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>