44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0676 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0676  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  343  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0763  hypothetical protein  47.4 
 
 
167 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.396097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1407  hypothetical protein  38.96 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.246502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2264  hypothetical protein  40.26 
 
 
167 aa  137  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  38.96 
 
 
166 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2513  hypothetical protein  38.96 
 
 
166 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3881  hypothetical protein  37.66 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.832488  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2703  hypothetical protein  41.56 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.600419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4848  Protein of unknown function DUF1790  38.96 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  37.91 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4947  hypothetical protein  38.56 
 
 
169 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399738  hitchhiker  0.000000153474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3770  hypothetical protein  36.6 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4064  Protein of unknown function DUF1790  36.6 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4025  Protein of unknown function DUF1790  36.6 
 
 
168 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.351333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4471  hypothetical protein  40.38 
 
 
170 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.39855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0854  hypothetical protein  34.94 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1376  Protein of unknown function DUF1790  34.34 
 
 
167 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1137  Protein of unknown function DUF1790  35.95 
 
 
166 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1641  hypothetical protein  34.64 
 
 
166 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1525  hypothetical protein  33.99 
 
 
220 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3105  hypothetical protein  37.01 
 
 
179 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1475  hypothetical protein  33.99 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2148  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.8454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1096  Protein of unknown function DUF1790  33.73 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.820328  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2546  hypothetical protein  35.06 
 
 
166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  34.42 
 
 
166 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3330  hypothetical protein  34.19 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.635014  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1141  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0039  hypothetical protein  34.21 
 
 
152 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158376  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3169  hypothetical protein  33.12 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2756  Protein of unknown function DUF1790  31.82 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3019  Protein of unknown function DUF1790  31.82 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2250  hypothetical protein  31.82 
 
 
166 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338275  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1259  hypothetical protein  31.37 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00906465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0622  hypothetical protein  30.32 
 
 
166 aa  101  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1322  hypothetical protein  30.97 
 
 
167 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19423  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3008  hypothetical protein  30.97 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719619  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3363  hypothetical protein  30.32 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2199  hypothetical protein  31.61 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00724399  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0991  hypothetical protein  26.8 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0359037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2646  hypothetical protein  28.39 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3255  hypothetical protein  24.32 
 
 
153 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0701128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0347  protein of unknown function DUF1790  25.86 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal  0.742766 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0169  hypothetical protein  25.86 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>