41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3169 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3169  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  343  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2250  hypothetical protein  83.73 
 
 		 166 aa  297  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3019  Protein of unknown function DUF1790  82.53 
 
 		 166 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2756  Protein of unknown function DUF1790  82.53 
 
 		 166 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1641  hypothetical protein  68.07 
 
 		 166 aa  250  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1475  hypothetical protein  67.47 
 
 		 243 aa  250  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1525  hypothetical protein  67.47 
 
 		 220 aa  249  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2148  hypothetical protein  65.66 
 
 		 166 aa  237  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.8454  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1376  Protein of unknown function DUF1790  55.97 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0854  hypothetical protein  54.09 
 
 		 167 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4947  hypothetical protein  50.89 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399738  hitchhiker  0.000000153474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1137  Protein of unknown function DUF1790  50 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2546  hypothetical protein  53.01 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3881  hypothetical protein  50.6 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.832488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4025  Protein of unknown function DUF1790  51.9 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.351333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1407  hypothetical protein  49.4 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.246502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  50.6 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4064  Protein of unknown function DUF1790  50.6 
 
 		 168 aa  184  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3770  hypothetical protein  50.6 
 
 		 168 aa  184  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4848  Protein of unknown function DUF1790  50.6 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0991  hypothetical protein  51.81 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0359037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3105  hypothetical protein  49.4 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2513  hypothetical protein  46.39 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1259  hypothetical protein  44.58 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00906465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2264  hypothetical protein  48.1 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  43.67 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0622  hypothetical protein  34.34 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2703  hypothetical protein  37.34 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.600419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1096  Protein of unknown function DUF1790  31.85 
 
 		 167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.820328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2199  hypothetical protein  31.33 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1322  hypothetical protein  34.13 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2646  hypothetical protein  32.93 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0763  hypothetical protein  31.74 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.396097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3330  hypothetical protein  31.17 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.635014  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0676  hypothetical protein  33.12 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4471  hypothetical protein  32.94 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.39855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3008  hypothetical protein  33.12 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3363  hypothetical protein  32.93 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1141  hypothetical protein  31.41 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0039  hypothetical protein  32.89 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158376  normal  0.484774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>