31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3255 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3255  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  317  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0701128  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0545  hypothetical protein  37.19 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1465  hypothetical protein  30.94 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344519  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0169  hypothetical protein  37.21 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0347  protein of unknown function DUF1790  37.21 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal  0.742766 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0281  hypothetical protein  25.71 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1137  Protein of unknown function DUF1790  26.72 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0676  hypothetical protein  24.32 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4064  Protein of unknown function DUF1790  27.48 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3770  hypothetical protein  27.48 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  23.48 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2148  hypothetical protein  24.65 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.8454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1407  hypothetical protein  29.08 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.246502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1259  hypothetical protein  29.01 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00906465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2546  hypothetical protein  27.48 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2250  hypothetical protein  27.27 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338275  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2115  hypothetical protein  25.62 
 
 
296 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4025  Protein of unknown function DUF1790  25.95 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.351333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0968  Protein of unknown function DUF1790  27.93 
 
 
171 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1624  hypothetical protein  25.38 
 
 
195 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2264  hypothetical protein  31.46 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0763  hypothetical protein  26.89 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.396097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4947  hypothetical protein  25.19 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399738  hitchhiker  0.000000153474 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0991  hypothetical protein  26.52 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0359037  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2703  hypothetical protein  24.62 
 
 
167 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.600419  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1376  Protein of unknown function DUF1790  22.31 
 
 
167 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  24.67 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2513  hypothetical protein  25.74 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  29.46 
 
 
166 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2756  Protein of unknown function DUF1790  25.19 
 
 
166 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3019  Protein of unknown function DUF1790  25.19 
 
 
166 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>