23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0545 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0545  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1465  hypothetical protein  39.1 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3255  hypothetical protein  37.19 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0701128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0169  hypothetical protein  37.29 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0347  protein of unknown function DUF1790  37.29 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal  0.742766 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2115  hypothetical protein  38.36 
 
 		 296 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1624  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  67.4  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  25.18 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2163  hypothetical protein  38.24 
 
 		 399 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2264  hypothetical protein  30.3 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0281  hypothetical protein  29.73 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2703  hypothetical protein  26.24 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.600419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1259  hypothetical protein  28.32 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00906465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1137  Protein of unknown function DUF1790  31.71 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4064  Protein of unknown function DUF1790  26.67 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3770  hypothetical protein  26.67 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  25.81 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4848  Protein of unknown function DUF1790  27.19 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4025  Protein of unknown function DUF1790  26 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.351333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3881  hypothetical protein  26.02 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.832488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1096  Protein of unknown function DUF1790  26.15 
 
 		 167 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.820328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  26.57 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0763  hypothetical protein  22.86 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.396097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>