252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2894 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2894  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  578  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.266524 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  52.82 
 
 
286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  55.56 
 
 
281 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  53.55 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3091  hypothetical protein  51.61 
 
 
283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.279163  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0712  hypothetical protein  51.96 
 
 
284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000213655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  52.33 
 
 
284 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  52.33 
 
 
284 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  52.33 
 
 
284 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  52.33 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  52.33 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  50 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  50.35 
 
 
284 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  51.07 
 
 
282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4546  hypothetical protein  52.33 
 
 
284 aa  301  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  50.35 
 
 
284 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  49.65 
 
 
284 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1178  hypothetical protein  53.57 
 
 
286 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  50 
 
 
284 aa  299  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  50 
 
 
284 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3380  hypothetical protein  51.43 
 
 
287 aa  299  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  50 
 
 
284 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  49.65 
 
 
285 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0713  hypothetical protein  51.6 
 
 
284 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  49.65 
 
 
285 aa  298  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0704  hypothetical protein  51.25 
 
 
284 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.253725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0683  hypothetical protein  51.25 
 
 
284 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0700496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  51.25 
 
 
284 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  297  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  297  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  297  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  297  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  49.29 
 
 
284 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  49.65 
 
 
287 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  50.53 
 
 
282 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  50.89 
 
 
280 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0486  hypothetical protein  49.11 
 
 
284 aa  289  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.100542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03667  hypothetical protein  48.94 
 
 
287 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2718  hypothetical protein  47.37 
 
 
294 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  45.64 
 
 
290 aa  258  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  44.21 
 
 
287 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  44.72 
 
 
284 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  44.72 
 
 
284 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  44.01 
 
 
288 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  44.37 
 
 
284 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  44.01 
 
 
284 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0722  hypothetical protein  41.28 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  42.16 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  44.01 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12760  hypothetical protein  43.66 
 
 
285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4456  hypothetical protein  42.25 
 
 
285 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2797  hypothetical protein  44.33 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4150  hypothetical protein  42.61 
 
 
285 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  43.82 
 
 
280 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  41.9 
 
 
286 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  41.81 
 
 
286 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0867  hypothetical protein  43.31 
 
 
285 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154337  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0906  hypothetical protein  43.4 
 
 
285 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.960335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5422  hypothetical protein  41.38 
 
 
300 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0739  hypothetical protein  41.61 
 
 
295 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0081  hypothetical protein  44.13 
 
 
279 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0374  hypothetical protein  41.43 
 
 
294 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.137383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0831  hypothetical protein  42.96 
 
 
287 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0522408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0902  hypothetical protein  42.96 
 
 
287 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4338  hypothetical protein  41.92 
 
 
292 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0529  hypothetical protein  41.58 
 
 
278 aa  224  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.402264  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02223  hypothetical protein  39.85 
 
 
290 aa  224  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.470659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0520  hypothetical protein  40.56 
 
 
302 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0577  hypothetical protein  40.21 
 
 
297 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0593  hypothetical protein  40.21 
 
 
297 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3112  hypothetical protein  40.21 
 
 
297 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0761  hypothetical protein  40.21 
 
 
297 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0080  hypothetical protein  40.21 
 
 
297 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1510  hypothetical protein  40.21 
 
 
297 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.782325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2938  hypothetical protein  40.21 
 
 
297 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0482  hypothetical protein  39.86 
 
 
297 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1653  hypothetical protein  40.75 
 
 
301 aa  221  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0070  hypothetical protein  39.65 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1053  hypothetical protein  42.81 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2855  hypothetical protein  40.21 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.801383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2713  hypothetical protein  40.21 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2181  hypothetical protein  39.51 
 
 
302 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0277901  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2806  hypothetical protein  39.51 
 
 
302 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.724657 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2795  hypothetical protein  39.51 
 
 
302 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3336  hypothetical protein  39.59 
 
 
305 aa  218  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134312  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0667  hypothetical protein  39.26 
 
 
290 aa  218  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1300  hypothetical protein  41.75 
 
 
283 aa  218  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0771  hypothetical protein  40.71 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0495801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3603  hypothetical protein  41.26 
 
 
290 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214493  hitchhiker  0.00628158 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0753  hypothetical protein  39.26 
 
 
290 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.523032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4126  hypothetical protein  39.16 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>