32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1609 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1609  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  251  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0248938  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3677  invasion gene expression up-regulator SirB  34.65 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2907  invasion gene expression up-regulator, SirB  33.86 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.493009  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3166  invasion gene expression up-regulator, SirB  34.13 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0800  invasion gene expression up-regulator, SirB  34.13 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0772  invasion gene expression up-regulator, SirB  34.13 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2564  hypothetical protein  31.75 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.44085  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2560  invasion gene expression up-regulator, SirB  29.6 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0147676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0700  invasion gene expression up-regulator SirB  30.95 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3734  invasion gene expression up-regulator SirB  30.95 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3611  invasion gene expression up-regulator SirB  30.95 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0384528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3543  Invasion gene expression up-regulator SirB  30.95 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.637299  hitchhiker  0.0000269359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0806  invasion gene expression up-regulator, SirB  33.07 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2064  sirB family protein  33.07 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000433498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2177  invasion gene expression up-regulator SirB  33.07 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0939064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3453  invasion gene expression up-regulator, SirB  30 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1992  invasion gene expression up-regulator SirB  35.25 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0896381  hitchhiker  0.00421382 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2458  hypothetical protein  33.07 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3124  invasion gene expression up-regulator SirB  29.46 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3550  SirB family protein  33.88 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0792  protein SirB, invasion gene expression up-regulator  27.05 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2112  Invasion gene expression up-regulator SirB  35.19 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0922  invasion gene expression up-regulator, SirB  33.33 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130475  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2405  Invasion gene expression up-regulator SirB  35.19 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0725  invasion gene expression up-regulator, SirB  30.89 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01252  hypothetical protein  29.84 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0944  hypothetical protein  30.58 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1287  Invasion gene expression up-regulator SirB  27.5 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1754  hypothetical protein  28.68 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000212251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2379  invasion gene expression up-regulator, SirB  34.31 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2335  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>