232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0774 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0774  glucosamine-6-phosphate deaminase  100 
 
 
249 aa  516  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3264  glucosamine-6-phosphate deaminase  69.8 
 
 
257 aa  360  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1394  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.2 
 
 
254 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.807703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  50 
 
 
255 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4486  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.49 
 
 
258 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698126  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0591  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.09 
 
 
259 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.858991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2627  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.62 
 
 
269 aa  191  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3109  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  39.84 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.25876  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2696  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  39.17 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4443  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  38.59 
 
 
257 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6213  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  36.96 
 
 
255 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4629  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.61 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1699  Glucosamine-6-phosphate deaminase  38.11 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297803  normal  0.026904 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1521  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.37 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00621711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3353  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.39 
 
 
274 aa  178  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5244  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.96 
 
 
259 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.965081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2098  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.91 
 
 
255 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2142  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.48 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784311  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.29 
 
 
236 aa  152  7e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.5 
 
 
235 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.15 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.55 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.55 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.55 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.55 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.55 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.55 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.55 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.6 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.33 
 
 
262 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.74 
 
 
262 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.15 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.35 
 
 
233 aa  129  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.28 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.19 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.73 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.68 
 
 
642 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.78 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.56 
 
 
260 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.64 
 
 
250 aa  121  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.64 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.62 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  33.61 
 
 
641 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.79 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  33.9 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.86 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.03 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.86 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0128  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.04 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.78 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.06 
 
 
249 aa  113  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30 
 
 
252 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30 
 
 
252 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.41 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.33 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.35 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.21 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  29.95 
 
 
234 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.19 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.6 
 
 
244 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
262 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3405  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  31.22 
 
 
255 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.7 
 
 
242 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.22 
 
 
256 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.66 
 
 
266 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.41 
 
 
263 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.91 
 
 
265 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.74 
 
 
259 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.62 
 
 
303 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  29.34 
 
 
639 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.74 
 
 
242 aa  103  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  29.92 
 
 
646 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.86 
 
 
266 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.88 
 
 
262 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.19 
 
 
266 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.49 
 
 
268 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.45 
 
 
260 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.17 
 
 
266 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.74 
 
 
279 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.81 
 
 
266 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.5 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.76 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.8 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0225  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  29.33 
 
 
243 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.535375  normal  0.600106 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.46 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1103  glucosamine-6-phosphate isomerase 2  30.57 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.265713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.49 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.4 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.09 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.88 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.88 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.88 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.88 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.88 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.95 
 
 
655 aa  96.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.64 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  29.3 
 
 
637 aa  95.9  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  28.57 
 
 
647 aa  95.5  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.91 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.4 
 
 
266 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>