167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1699 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1699  Glucosamine-6-phosphate deaminase  100 
 
 
252 aa  524  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297803  normal  0.026904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4486  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  59.67 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698126  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3109  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  54.15 
 
 
254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.25876  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6213  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  50.61 
 
 
255 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1521  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.15 
 
 
251 aa  222  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00621711  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2696  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  43.15 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3353  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.08 
 
 
274 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0591  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.37 
 
 
259 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.858991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2627  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.9 
 
 
269 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4629  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.99 
 
 
258 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4443  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  36.65 
 
 
257 aa  180  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2098  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.46 
 
 
255 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2142  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.06 
 
 
255 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784311  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0774  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.55 
 
 
249 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5244  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.2 
 
 
259 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.965081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3264  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.02 
 
 
257 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.71 
 
 
255 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1394  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.69 
 
 
254 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.807703  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.44 
 
 
262 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  121  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.73 
 
 
250 aa  111  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.15 
 
 
233 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.47 
 
 
266 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3128  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.51 
 
 
266 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.38 
 
 
242 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.63 
 
 
266 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.86 
 
 
266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.86 
 
 
266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.86 
 
 
266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.86 
 
 
266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.86 
 
 
266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.77 
 
 
266 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1203  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.77 
 
 
266 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.64 
 
 
235 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.5 
 
 
277 aa  102  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.95 
 
 
242 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.96 
 
 
241 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.25 
 
 
266 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.614639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.25 
 
 
266 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.25 
 
 
266 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.45 
 
 
261 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00635  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.35 
 
 
266 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.35 
 
 
266 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.5 
 
 
233 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.35 
 
 
266 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0703  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.35 
 
 
266 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00284745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.76 
 
 
256 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00626  hypothetical protein  29.35 
 
 
266 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2978  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.35 
 
 
266 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.35 
 
 
266 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.35 
 
 
266 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.21 
 
 
266 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.35 
 
 
266 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.02 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  31.66 
 
 
252 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  31.66 
 
 
252 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1114  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.19 
 
 
266 aa  99.4  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.646109  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.51 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.36 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.98 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.9 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.85 
 
 
266 aa  98.6  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.4 
 
 
245 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.39 
 
 
244 aa  98.6  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.85 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.8 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.37 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.94 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.57 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1103  glucosamine-6-phosphate isomerase 2  28.25 
 
 
243 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.265713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.6 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.86 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.64 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.51 
 
 
261 aa  92  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  25.29 
 
 
642 aa  91.7  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0150  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.49 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  27.2 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.18 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.98 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.22 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.31 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25.63 
 
 
641 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.96 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.73 
 
 
270 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0128  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.58 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  27.41 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.46 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.49 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25.53 
 
 
655 aa  86.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>