More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3228 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3228  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 499 aa  1020    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.97946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7342  aldehyde dehydrogenase  65.78 
 
 		 498 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524049  normal  0.607968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2603  aldehyde dehydrogenase  48.29 
 
 		 532 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2802  aldehyde dehydrogenase  49.3 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163668  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.95 
 
 		 498 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.6 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.65 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 496 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  42.15 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  43.92 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.79 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  40.8 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  42.21 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.62 
 
 		 508 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  42.13 
 
 		 483 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.32 
 
 		 494 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  41.95 
 
 		 494 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.58 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  41.41 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  41.04 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.25 
 
 		 494 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.93 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 		 493 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.62 
 
 		 496 aa  346  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  42.51 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.05 
 
 		 494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  39.55 
 
 		 494 aa  343  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.26 
 
 		 504 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.92 
 
 		 494 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.92 
 
 		 494 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.84 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.41 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.72 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.72 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  38.65 
 
 		 494 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  41.18 
 
 		 490 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 		 494 aa  339  8e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 493 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3634  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.21 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.93 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.22 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.65 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 		 490 aa  335  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  40.99 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  41.92 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 		 493 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.53 
 
 		 503 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 492 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 491 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.63 
 
 		 501 aa  332  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  41.37 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  40.37 
 
 		 493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  41.68 
 
 		 498 aa  329  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7969  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 477 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  40.68 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  40.68 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.08 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  40.68 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 491 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.37 
 
 		 493 aa  326  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  39.02 
 
 		 483 aa  326  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.17 
 
 		 493 aa  326  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  38.76 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 		 490 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.17 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 		 501 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  39.84 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  40.28 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.52 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  36.8 
 
 		 489 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.37 
 
 		 496 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1171  aldehyde dehydrogenase family protein  40.04 
 
 		 492 aa  323  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 		 498 aa  322  7e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 		 501 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 		 501 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3610  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.63 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  41.55 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>