22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2712 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2712  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3367  hypothetical protein  55.56 
 
 		 221 aa  207  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3012  hypothetical protein  55.56 
 
 		 221 aa  207  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1564  hypothetical protein  46.3 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1230  hypothetical protein  32.27 
 
 		 206 aa  88.2  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2994  hypothetical protein  30.36 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2947  hypothetical protein  32.17 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425163  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5861  hypothetical protein  23.9 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5010  hypothetical protein  27.31 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0268144 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9611  hypothetical protein  28.05 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2712  hypothetical protein  26.67 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00974  hypothetical protein  22.71 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1229  hypothetical protein  30.93 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3135  hypothetical protein  23.56 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0160  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.557992  normal  0.0668896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 		 630 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6083  hypothetical protein  21.85 
 
 		 499 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00516382  hitchhiker  0.00130311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0176  hypothetical protein  25.75 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.228365  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03123  hypothetical protein  26.45 
 
 		 115 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1758  hypothetical protein  22 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5154  hypothetical protein  27.17 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0623  hypothetical protein  26.25 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>