19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5010 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5010  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  510  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0268144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2509  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 		 308 aa  85.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.235257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2712  hypothetical protein  29.8 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1229  hypothetical protein  27.13 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2947  hypothetical protein  27.53 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425163  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1564  hypothetical protein  25.97 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9611  hypothetical protein  24.43 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2994  hypothetical protein  27.09 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2712  hypothetical protein  25.87 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5861  hypothetical protein  22.03 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0160  hypothetical protein  24.6 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.557992  normal  0.0668896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00974  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103803  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3012  hypothetical protein  26.19 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3367  hypothetical protein  26.19 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3135  hypothetical protein  26.6 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1230  hypothetical protein  25.81 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2223  hypothetical protein  25.85 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.879949  normal  0.438899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0482  hypothetical protein  28.3 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.724265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00490  hypothetical protein  25.66 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>