17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1230 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  430  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2712  hypothetical protein  31.82 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2994  hypothetical protein  28.64 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2712  hypothetical protein  24.78 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9611  hypothetical protein  24 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1564  hypothetical protein  28.5 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1521  hypothetical protein  37.93 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1520  hypothetical protein  43.55 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3367  hypothetical protein  27.68 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3012  hypothetical protein  27.68 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1229  hypothetical protein  26.32 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5010  hypothetical protein  25.81 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0268144 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5861  hypothetical protein  23.29 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00974  hypothetical protein  22.22 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0623  hypothetical protein  21.83 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3135  hypothetical protein  23.04 
 
 		 219 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2509  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 308 aa  41.2  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.235257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>