22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9611 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9611  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  467  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2712  hypothetical protein  30.59 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00974  hypothetical protein  25.93 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3135  hypothetical protein  28.32 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1564  hypothetical protein  28.04 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5861  hypothetical protein  25.6 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1230  hypothetical protein  24 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0160  hypothetical protein  27.6 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.557992  normal  0.0668896 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5010  hypothetical protein  24.43 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0268144 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2712  hypothetical protein  27.8 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2994  hypothetical protein  25.66 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3367  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3012  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1229  hypothetical protein  26.64 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03123  hypothetical protein  30.11 
 
 		 115 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00490  hypothetical protein  24.87 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2947  hypothetical protein  25.66 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425163  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4122  hypothetical protein  32.14 
 
 		 258 aa  45.1  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1758  hypothetical protein  28.89 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2223  hypothetical protein  22.96 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.879949  normal  0.438899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0482  hypothetical protein  21.82 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.724265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29845  predicted protein  28.12 
 
 		 437 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>