14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1229 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1229  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  434  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0160  hypothetical protein  31.69 
 
 
240 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.557992  normal  0.0668896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2509  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.235257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5010  hypothetical protein  27.13 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0268144 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2712  hypothetical protein  29.9 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5861  hypothetical protein  30.95 
 
 
252 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2994  hypothetical protein  32.26 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1230  hypothetical protein  26.32 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03123  hypothetical protein  30.56 
 
 
115 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2712  hypothetical protein  24.67 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9611  hypothetical protein  26.64 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00974  hypothetical protein  27.72 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103803  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3367  hypothetical protein  25.98 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3012  hypothetical protein  25.98 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>