16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3135 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3135  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  460  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9611  hypothetical protein  28.32 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2712  hypothetical protein  27.07 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5861  hypothetical protein  23.92 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2994  hypothetical protein  28.22 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00490  hypothetical protein  26.01 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2712  hypothetical protein  23.04 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00974  hypothetical protein  24.89 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103803  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5010  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0268144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2947  hypothetical protein  23.85 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0482  hypothetical protein  24.24 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.724265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2223  hypothetical protein  31.58 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.879949  normal  0.438899 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1758  hypothetical protein  37.31 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1564  hypothetical protein  22.37 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0456  hypothetical protein  31.97 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.62748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1230  hypothetical protein  23.04 
 
 		 206 aa  42  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>