12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2947 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2947  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425163  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2712  hypothetical protein  30.87 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5010  hypothetical protein  27.53 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0268144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2994  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3367  hypothetical protein  28.03 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3012  hypothetical protein  28.03 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5861  hypothetical protein  24.6 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3135  hypothetical protein  23.85 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9611  hypothetical protein  25.66 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2712  hypothetical protein  23.04 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1564  hypothetical protein  23.81 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00974  hypothetical protein  21.28 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>