16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1564 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1564  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  460  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3367  hypothetical protein  49.08 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3012  hypothetical protein  49.08 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2712  hypothetical protein  46.3 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5861  hypothetical protein  22.71 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9611  hypothetical protein  28.04 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2712  hypothetical protein  27.51 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5010  hypothetical protein  25.97 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0268144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1230  hypothetical protein  28.5 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2994  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03123  hypothetical protein  28.16 
 
 		 115 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00974  hypothetical protein  25.96 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2947  hypothetical protein  23.81 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425163  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3135  hypothetical protein  22.37 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1758  hypothetical protein  22.07 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0456  hypothetical protein  32.5 
 
 		 258 aa  42  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.62748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>