11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1758 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1758  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  400  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02462  hypothetical protein  26.95 
 
 		 248 aa  48.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2712  hypothetical protein  22.58 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03123  hypothetical protein  30.63 
 
 		 115 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3135  hypothetical protein  37.31 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9611  hypothetical protein  28.89 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1564  hypothetical protein  22.07 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00974  hypothetical protein  23.73 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2509  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.235257 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5861  hypothetical protein  25.26 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2712  hypothetical protein  22.82 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>