34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1911 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1911  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3918  hypothetical protein  40.54 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.693655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  38.16 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  29.67 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  31.78 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  37.68 
 
 		 250 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  34.78 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  33.75 
 
 		 280 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  33.75 
 
 		 280 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  30.77 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  28.18 
 
 		 285 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  30.49 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  28.3 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  26 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  27.4 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  32.47 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  30.53 
 
 		 284 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 		 213 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  28.95 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  35.29 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  34.29 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  34.29 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  46.34 
 
 		 212 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  32.86 
 
 		 115 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  36.23 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  32.86 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  35.63 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  36.84 
 
 		 266 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  35.62 
 
 		 156 aa  40.8  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  35.62 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2061  hypothetical protein  34.78 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324939  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  31.25 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  35.82 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>