58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1838 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1838  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
167 aa  333  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.31 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.37 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3641  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.62 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302085  normal  0.062133 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.31 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  29.93 
 
 
182 aa  47.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  26.72 
 
 
189 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.46 
 
 
251 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.46 
 
 
227 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.82 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.59 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.25 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.14 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  36.76 
 
 
185 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.85 
 
 
242 aa  45.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  41.1 
 
 
187 aa  44.3  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  30 
 
 
187 aa  44.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.84 
 
 
176 aa  44.3  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.64 
 
 
279 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.82 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.06 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.64 
 
 
272 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.69 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  26.26 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  38.75 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  35.29 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.95 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
305 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.62 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.48 
 
 
290 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  34.33 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  34.33 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2324  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.48 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1899  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.66 
 
 
182 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  29.33 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.1 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32 
 
 
253 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.73 
 
 
273 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.23 
 
 
249 aa  41.2  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.96 
 
 
176 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  28.86 
 
 
175 aa  41.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.12 
 
 
437 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.03 
 
 
171 aa  41.2  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  32 
 
 
181 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.33 
 
 
317 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12570  Diacylglycerol kinase  33.33 
 
 
231 aa  40.8  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  32 
 
 
211 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.86 
 
 
183 aa  40.8  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  32 
 
 
211 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  40.8  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.64 
 
 
169 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  35.21 
 
 
446 aa  40.8  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  32.14 
 
 
178 aa  40.8  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45 
 
 
170 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.04 
 
 
194 aa  40.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  31 
 
 
299 aa  40.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>