29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1478 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1478  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0012  hypothetical protein  44.44 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185355  normal  0.165808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2382  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0380157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3297  metal-dependent phosphohydrolase  45.69 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000309541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23030  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  40.64 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000961402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1009  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  42.13 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.272984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3053  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  40.87 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.918876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1720  HD domain-containing protein  38.59 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.939077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3251  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  40.48 
 
 		 267 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3070  metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0990  metal-dependent phosphohydrolase  37.24 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.817685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1195  HD domain-containing protein  41.26 
 
 		 215 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1389  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000307916  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0132  metal-dependent phosphohydrolase HD region  35.29 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1232  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1712  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0469  metal dependent phosphohydrolase  32.44 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00402223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2193  HD domain-containing protein  34.98 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2452  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.230863  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  51.02 
 
 		 413 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  47.62 
 
 		 431 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 403 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  47.62 
 
 		 399 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  51.35 
 
 		 401 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  54.05 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2424  HD-GYP domain-containing protein  35.23 
 
 		 400 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  42.86 
 
 		 404 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  47.37 
 
 		 402 aa  42.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>