20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3297 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3297  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000309541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1009  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  53.08 
 
 
267 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.272984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2382  metal dependent phosphohydrolase  57.14 
 
 
262 aa  275  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0380157  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3251  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  50.97 
 
 
267 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3053  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  51.88 
 
 
262 aa  255  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.918876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3070  metal dependent phosphohydrolase  46.72 
 
 
264 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1195  HD domain-containing protein  55.45 
 
 
215 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184086  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0012  hypothetical protein  41.26 
 
 
276 aa  208  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185355  normal  0.165808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1478  metal-dependent phosphohydrolase  45.69 
 
 
299 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0990  metal-dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 
262 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.817685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1720  HD domain-containing protein  37.25 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.939077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23030  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  35.2 
 
 
259 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000961402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1712  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 
272 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0132  metal-dependent phosphohydrolase HD region  35.2 
 
 
289 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1389  metal dependent phosphohydrolase  37.87 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000307916  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1232  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
271 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2193  HD domain-containing protein  33.6 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2452  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.230863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0469  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
273 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00402223  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.42 
 
 
744 aa  42.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>