19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1009 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1009  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  100 
 
 		 267 aa  544  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.272984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3251  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  94.38 
 
 		 267 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3297  metal-dependent phosphohydrolase  53.08 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3053  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  48.25 
 
 		 262 aa  244  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.918876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2382  metal dependent phosphohydrolase  47.24 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0380157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1195  HD domain-containing protein  51.78 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3070  metal dependent phosphohydrolase  44.66 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0012  hypothetical protein  41.27 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185355  normal  0.165808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1478  metal-dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0990  metal-dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.817685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23030  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  31.5 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000961402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1720  HD domain-containing protein  36.07 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.939077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1712  metal dependent phosphohydrolase  37.45 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0132  metal-dependent phosphohydrolase HD region  37.35 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1232  metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 		 271 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1389  metal dependent phosphohydrolase  38.43 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000307916  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2452  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 		 255 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.230863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0469  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00402223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2193  HD domain-containing protein  33.47 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>