20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3053 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3053  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.918876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3070  metal dependent phosphohydrolase  62.55 
 
 
264 aa  300  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3297  metal-dependent phosphohydrolase  51.88 
 
 
265 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000309541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2382  metal dependent phosphohydrolase  49.43 
 
 
262 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0380157  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1009  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  48.25 
 
 
267 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.272984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3251  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  49.58 
 
 
267 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1195  HD domain-containing protein  53.43 
 
 
215 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1478  metal-dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 
299 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0990  metal-dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.817685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0012  hypothetical protein  34.92 
 
 
276 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185355  normal  0.165808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1712  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
272 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23030  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  33.75 
 
 
259 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000961402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1720  HD domain-containing protein  33.2 
 
 
257 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.939077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0132  metal-dependent phosphohydrolase HD region  37.34 
 
 
289 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1389  metal dependent phosphohydrolase  40.99 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000307916  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1232  metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2452  metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.230863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2193  HD domain-containing protein  34.92 
 
 
282 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0469  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00402223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1644  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 
210 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>