19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0132 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0132  metal-dependent phosphohydrolase HD region  100 
 
 
289 aa  583  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1712  metal dependent phosphohydrolase  52.69 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1232  metal dependent phosphohydrolase  42.62 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2193  HD domain-containing protein  44.66 
 
 
282 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2382  metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 
262 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0380157  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1009  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  37.35 
 
 
267 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.272984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3251  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  35.9 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3053  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain  37.34 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.918876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1478  metal-dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
299 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3297  metal-dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
265 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000309541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3070  metal dependent phosphohydrolase  38.49 
 
 
264 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2452  metal dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 
255 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.230863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1389  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 
267 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000307916  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1195  HD domain-containing protein  43.65 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184086  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0012  hypothetical protein  30.52 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185355  normal  0.165808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23030  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  29.96 
 
 
259 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000961402  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0990  metal-dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.817685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1720  HD domain-containing protein  26.03 
 
 
257 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.939077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0469  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
273 aa  94  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00402223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>