295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0506 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0506  lactoylglutathione lyase-like protein  100 
 
 
126 aa  265  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  48.8 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  48.8 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.4 
 
 
131 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3968  hypothetical protein  50.4 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  47.97 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3237  lactoylglutathione lyase  49.6 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  47.54 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.6 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.0502587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.6 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  49.22 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.2 
 
 
131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.107987 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.28 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.15 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.15 
 
 
131 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.34 
 
 
131 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114931  normal  0.177904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2724  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.65 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.8 
 
 
131 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1387  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.6 
 
 
131 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.94622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2242  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.28 
 
 
131 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2289  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.03 
 
 
131 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.713044  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0056  glyoxalase family protein  44 
 
 
131 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5815  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.53 
 
 
131 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3968  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44 
 
 
149 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.477474  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5251  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.72 
 
 
131 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0056  glyoxalase family protein  44 
 
 
131 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.471593  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.2 
 
 
131 aa  103  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.799398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.8 
 
 
131 aa  103  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.553638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03060  hypothetical protein  42.4 
 
 
131 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1399  putative lactoylglutathione lyase  42.06 
 
 
132 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.48 
 
 
132 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.4 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1707  putative lactoylglutathione lyase  44.44 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.8 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.8 
 
 
135 aa  94  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.278611  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002900  lactoylglutathione lyase  40.8 
 
 
131 aa  93.6  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.796352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.64 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0933  lactoylglutathione lyase  42.02 
 
 
124 aa  90.5  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.8 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464949  normal  0.0262279 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  35.94 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  36.51 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  37.21 
 
 
128 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2217  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.1 
 
 
125 aa  84  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.196245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  37.88 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  37.8 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  37.3 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  37.3 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  37.8 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  37.3 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.71 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000885753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  37.98 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  36.51 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2118  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  37.3 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10470  lactoylglutathione lyase-like lyase  36.51 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2532  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487791  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  36.8 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  38.1 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  37.88 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  37.98 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  35.43 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  35.43 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  37.98 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  35.43 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  37.21 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  35.43 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  37.21 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0745  lactoylglutathione lyase, putative  40.34 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  35.16 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  36.72 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  34.62 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  33.59 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0307  hypothetical protein  35.48 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  34.62 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  33.07 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  34.88 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0165  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.76 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  34.92 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07081  glyoxalase I  36.22 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  35.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2232  lactoylglutathione lyase  35.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00348977  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  35.94 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  34.92 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0652  glyoxalase I  35.43 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06791  glyoxalase I  36.22 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0508996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  35.43 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  36.92 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2104  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00629536  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  36.15 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  36.92 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  32.54 
 
 
163 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2281  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00527881  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  34.88 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2057  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000866783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  34.13 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>