293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4708 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
131 aa  263  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.0502587 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.85 
 
 
131 aa  225  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3237  lactoylglutathione lyase  83.08 
 
 
131 aa  223  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3968  hypothetical protein  82.31 
 
 
131 aa  222  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1387  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70 
 
 
131 aa  192  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.94622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  68.46 
 
 
131 aa  191  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.69 
 
 
131 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.799398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0056  glyoxalase family protein  64.89 
 
 
131 aa  184  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.12 
 
 
131 aa  183  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.65 
 
 
131 aa  182  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0056  glyoxalase family protein  64.12 
 
 
131 aa  181  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.471593  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.66 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2289  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.54 
 
 
131 aa  170  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.713044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5815  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.31 
 
 
131 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
131 aa  161  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.553638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2724  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.31 
 
 
132 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.23 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3968  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.02 
 
 
149 aa  160  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.477474  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1399  putative lactoylglutathione lyase  59.54 
 
 
132 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.31 
 
 
132 aa  156  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5251  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.69 
 
 
131 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.38 
 
 
131 aa  153  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.107987 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03060  hypothetical protein  58.78 
 
 
131 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.92 
 
 
131 aa  150  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114931  normal  0.177904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2242  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.38 
 
 
131 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.92 
 
 
131 aa  150  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.92 
 
 
131 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002900  lactoylglutathione lyase  54.2 
 
 
131 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.796352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1707  putative lactoylglutathione lyase  57.5 
 
 
121 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2118  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.92 
 
 
131 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2532  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.92 
 
 
131 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487791  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.39 
 
 
135 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.278611  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0933  lactoylglutathione lyase  51.22 
 
 
124 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0506  lactoylglutathione lyase-like protein  49.6 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  44.44 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  44.44 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.62 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  45.16 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  41.41 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  43.08 
 
 
131 aa  90.5  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0165  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.15 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
131 aa  87.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464949  normal  0.0262279 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  37.98 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  39.39 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  39.53 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  39.53 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  34.62 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2217  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.8 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.196245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  38.28 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0307  hypothetical protein  38.71 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  38.93 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0247  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  35.66 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2432  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.23 
 
 
264 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  37.16 
 
 
318 aa  77.4  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  36.92 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  34.38 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  37.69 
 
 
128 aa  77  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.21 
 
 
126 aa  77  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  35.38 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2191  lactoylglutathione lyase  36.72 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1948  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.2 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000885753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  36.92 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.7 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  36.36 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0440  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.97 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.55 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.459342  normal  0.516309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0969  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.61 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.387103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  37.59 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0511  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.81 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  37.23 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  40 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  34.65 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  34.38 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  36.72 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  38.46 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  35.94 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  35.94 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  39.23 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  34.56 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  35.82 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0359  lactoylglutathione lyase  36.36 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135613  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.92 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  38.52 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  34.65 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1549  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  34.88 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  35.16 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  37.69 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.5 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  32.06 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  35.88 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  34.88 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  35.29 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  34.09 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10470  lactoylglutathione lyase-like lyase  36 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  34.65 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  35.11 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>