293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3237 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3237  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
131 aa  263  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  99.24 
 
 
131 aa  261  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3968  hypothetical protein  90.84 
 
 
131 aa  244  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.08 
 
 
131 aa  223  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.0502587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1387  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.76 
 
 
131 aa  201  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.94622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  71.76 
 
 
131 aa  200  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.47 
 
 
131 aa  194  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.799398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0056  glyoxalase family protein  66.15 
 
 
131 aa  184  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0056  glyoxalase family protein  65.38 
 
 
131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.471593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.62 
 
 
131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.42 
 
 
133 aa  177  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.38 
 
 
131 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2289  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.36 
 
 
131 aa  174  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.713044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5815  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.08 
 
 
131 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.31 
 
 
131 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.553638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2724  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.09 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5251  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.23 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3968  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.92 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.477474  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.25 
 
 
131 aa  160  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1399  putative lactoylglutathione lyase  57.58 
 
 
132 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.49 
 
 
131 aa  158  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.107987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.09 
 
 
132 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.23 
 
 
131 aa  156  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.46 
 
 
131 aa  155  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114931  normal  0.177904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.46 
 
 
131 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2242  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.15 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03060  hypothetical protein  55.38 
 
 
131 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1707  putative lactoylglutathione lyase  58.47 
 
 
121 aa  146  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2118  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.78 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2532  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.78 
 
 
131 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487791  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002900  lactoylglutathione lyase  51.54 
 
 
131 aa  140  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.796352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.92 
 
 
135 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.278611  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0933  lactoylglutathione lyase  48.39 
 
 
124 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0506  lactoylglutathione lyase-like protein  49.6 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  41.27 
 
 
126 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  41.27 
 
 
126 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0165  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.97 
 
 
142 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  42.19 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  43.41 
 
 
131 aa  93.6  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.01 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  43.9 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  36.15 
 
 
136 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464949  normal  0.0262279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  41.54 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  36.15 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  39.23 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  39.06 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  38.46 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  41.54 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  38.46 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  34.88 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  39.53 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  39.53 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2217  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.31 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.196245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  38.76 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  37.31 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0247  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.12 
 
 
252 aa  77  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.98 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6549  lactoylglutathione lyase  37.4 
 
 
130 aa  77  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1948  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.12 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  37.98 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  40.74 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0307  hypothetical protein  38.58 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  39.39 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  33.59 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10470  lactoylglutathione lyase-like lyase  37.21 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0969  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.09 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.387103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.7 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  36.84 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  37.5 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  35.66 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.2 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  35.43 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  35.43 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  35.43 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  36.92 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  37.98 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  35.43 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  33.08 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  32.03 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  38.76 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  34.65 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  34.38 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0511  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.78 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.459342  normal  0.516309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  35.66 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  34.38 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  33.59 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  34.38 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0440  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.76 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  30.83 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2191  lactoylglutathione lyase  33.59 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  38.52 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  32.31 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  32.31 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.29 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000885753  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  37.98 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  38.64 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>