287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2070 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  265  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3968  hypothetical protein  77.1 
 
 
131 aa  213  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1387  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.57 
 
 
131 aa  207  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.94622  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3237  lactoylglutathione lyase  71.76 
 
 
131 aa  200  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.76 
 
 
131 aa  199  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70 
 
 
131 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.77 
 
 
131 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.46 
 
 
131 aa  191  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.0502587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.18 
 
 
131 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.799398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0056  glyoxalase family protein  66.15 
 
 
131 aa  183  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0056  glyoxalase family protein  65.38 
 
 
131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.471593  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2289  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.41 
 
 
131 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.713044  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.36 
 
 
131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 
133 aa  169  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.83 
 
 
131 aa  166  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.107987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5251  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.77 
 
 
131 aa  164  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5815  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.23 
 
 
131 aa  163  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.31 
 
 
131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.553638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2242  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.92 
 
 
131 aa  157  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.69 
 
 
131 aa  155  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114931  normal  0.177904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.46 
 
 
131 aa  155  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.69 
 
 
131 aa  154  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1399  putative lactoylglutathione lyase  59.09 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1707  putative lactoylglutathione lyase  61.67 
 
 
121 aa  153  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2724  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.82 
 
 
132 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3968  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.85 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.477474  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.06 
 
 
132 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002900  lactoylglutathione lyase  50.77 
 
 
131 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.796352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03060  hypothetical protein  49.23 
 
 
131 aa  131  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2118  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.67 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2532  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.67 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487791  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0933  lactoylglutathione lyase  47.58 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0506  lactoylglutathione lyase-like protein  49.22 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.31 
 
 
135 aa  110  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.278611  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  45.31 
 
 
126 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  45.31 
 
 
126 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0165  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.08 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  44.09 
 
 
131 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  44.44 
 
 
130 aa  90.1  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.31 
 
 
131 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464949  normal  0.0262279 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
122 aa  87.4  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.84 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2217  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.4 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.196245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  38.28 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0969  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.88 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.387103  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  38.76 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10470  lactoylglutathione lyase-like lyase  37.21 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  38.76 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2191  lactoylglutathione lyase  35.88 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  37.21 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  37.98 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  37.78 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  37.04 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  37.04 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  36.15 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  33.85 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  34.88 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  38.76 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  34.09 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  37.01 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  37.12 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  37.31 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  36.43 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  37.5 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  38.76 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  35.94 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  35.66 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  35.43 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  36.15 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  37.98 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  37.8 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  37.21 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  38.64 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.07 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000885753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  34.11 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.89 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  36.43 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  36.22 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  38.28 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  34.13 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  34.35 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2343  lactoylglutathione lyase  37.21 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.973828  normal  0.362126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  34.35 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  37.09 
 
 
318 aa  70.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  34.11 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  34.88 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0906  lactoylglutathione lyase  36.65 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  34.35 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  32.28 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  35.16 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  32.28 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>